Botchan es un joven impulsivo y de carácter franco que, tras concluir sus estudios en Tokio, acepta un puesto como profesor de matemáticas en una escuela secundaria de una ciudad provinciana de Japón. Su llegada lo enfrenta a un ambiente desconocido, marcado por las rivalidades entre profesores, las travesuras de los alumnos y las convenciones sociales que le resultan difíciles de aceptar. Incapaz de disimular sus opiniones o tolerar lo que considera hipocresía, Botchan se ve envuelto en una serie de conflictos que ponen a prueba su sentido de la justicia y su relación con quienes lo rodean.